重磅！次定量檢測完整的人類(lèi)蛋白質(zhì)組
2016年8月3日--在項新的研究中，來(lái)自瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院（ETH Zurich）和美系統生物學(xué)研究所等機構的研究人員開(kāi)發(fā)出人類(lèi)SRMAtlas（Human SRMAtlas），即靶向識別和可重復地定量預測的人類(lèi)蛋白質(zhì)組中所有蛋白質(zhì)的度特異性質(zhì)譜檢測方法匯編目錄，包括許多剪接變異體、非同義突變和翻譯后修飾。利用種被稱(chēng)作選擇性反應監控（selected reaction monitoring, SRM）的技術(shù)，研究人員利用166174種已被充分了解的化學(xué)合成蛋白特征性肽（proteotypic peptide）開(kāi)發(fā)出這些檢測方法。相關(guān)研究結果發(fā)表在2016年7月28日那期Cell期刊上，論文標題為“Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome”。論文第作者為來(lái)自美系統生物學(xué)研究所的Ulrike Kusebauch博士。論文通信作者為來(lái)自美系統生物學(xué)研究所的Robert Moritz教授和來(lái)自瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的Ruedi Aebersold。
SRMAtlas資源在http://www.srmatlas.org網(wǎng)站上可以免費獲取，將有助于公平地開(kāi)展重點(diǎn)的、假設驅動(dòng)的和大型蛋白質(zhì)組規模的研究。研究人員期待這資源將大地加快基于蛋白質(zhì)的實(shí)驗室生物學(xué)發(fā)展從而有助理解**轉化和健康軌跡，這是因為如今在理論上能夠鑒定和定量檢測出任何樣品中的任何人類(lèi)蛋白。
能夠可靠地和可重復性地檢測任何組織或細胞類(lèi)型的人類(lèi)蛋白質(zhì)組中的任何種蛋白在理解系統層次的性質(zhì)以及正常生理下和患病時(shí)的特異性途徑方面引發(fā)變革。在Moritz教授實(shí)驗室中，研究團隊能夠利用SRM方法產(chǎn)生并驗證了種由度特異性地靶向蛋白質(zhì)組檢測方法組成的匯編目錄，而且通過(guò)這種廣泛獲取的、靈敏的和強健的靶向質(zhì)譜方法SRM，能夠定量檢測20,277種已被標注的人類(lèi)蛋白中的99.7%。這種人類(lèi)SRMAtlas明確的檢測坐標來(lái)確定性地鑒別生物樣品中蛋白質(zhì)特征性的肽。
盡管2003年，人們成功地了完**類(lèi)基因組計劃（Human Genome Project），構建出所有人類(lèi)基因的目錄，但是大多數蛋白質(zhì)研究仍然聚焦在在繪制出人類(lèi)基因組圖譜之前科學(xué)們研究的蛋白中相對較小的部分蛋白上。若要超越這種停滯不前的蛋白質(zhì)-基因組學(xué)研究方法，就應需要為幾乎每種人類(lèi)蛋白開(kāi)發(fā)度特異性的檢測方法。利用人類(lèi)SRMAtlas等資源，測量任何種人類(lèi)蛋白質(zhì)的前景如今變成現實(shí)。如今，人類(lèi)SRMAtlas已經(jīng)過(guò)驗證的質(zhì)譜檢測方法，這些檢測方法是基于種統的致的檢測人類(lèi)蛋白質(zhì)組中幾乎每種蛋白的過(guò)程開(kāi)發(fā)出的SRM技術(shù)而開(kāi)發(fā)的。這些檢測方法可快速地用于系統生物學(xué)和生物醫學(xué)研究中以便度靈敏地和度選擇性地鑒定和定量檢測任何種人類(lèi)蛋白，以及指導完整的蛋白質(zhì)圖譜繪制來(lái)了解它們的生物學(xué)功能。
個(gè)人化醫學(xué)獎依賴(lài)于分子特征來(lái)監控人們的健康狀態(tài)，信號來(lái)鑒定健康軌跡發(fā)生的變化，以及先在臨床試驗隨后在臨床實(shí)踐中信息來(lái)讓合適的患者匹配正確的**。這種人類(lèi)SRMAtlas計劃穩步地將蛋白組學(xué)推到前沿，并且為蛋白質(zhì)組學(xué)在*癥登月計劃（Cancer Moonshot）中發(fā)揮較大的作用添磚加瓦。
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